Zarządzeniem nr 2/2021 Dyrektora Urzędu Żeglugi Śródlądowej w Szczecinie z dnia 16 kwietnia 2021 r. nadano nowy Regulamin Organizacyjny, na podstawie którego określono schemat organizacyjny, zadania Urzędu oraz zakres działania pracowników i Dyrektora Urzędu.